論文図表を読む作法PREMIUM

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【目次】
★はPREMIUM版で追加された項目

第1章 色々な解析に使えるエッセンシャル

第2章 核酸解析
★3 サザンブロット/ノーザンブロット
★11 RNA-FISH

第3章 イメージング
★1 位相差顕微鏡/微分干渉顕微鏡
★2 共焦点レーザー走査型顕微鏡
★5 超多色染色
★8 CLEM
★9 二光子顕微鏡
★10 ライトシート顕微鏡
★11 全反射照明蛍光顕微鏡
★12 超解像顕微鏡法
★13 FRAP

第4章 細胞の形態や性質の解析
★2 マスサイトメトリー(CyTOF)
★3 イメージングフローサイトメトリー
★4 ゴーストサイトメトリー
★6 Fucci

第5章 タンパク質解析
★14 Yeast two-hybrid system
★18 AlphaScreen
★19 PEA(ハイマルチプレックスイムノアッセイ)

第6章 代謝解析
★6 イメージング質量分析

第7章 実験動物・遺伝子改変動物解析
★5 (心)エコー
★8 組織透明化技術
★12 化学遺伝学
★16 ロータロッドテスト
★17 プレパルス・インヒビションテスト

第8章 シークエンサーなどを用いた網羅的配列解析とその応用
・共通
★2 シークエンスデータ総論1(ショートリード:illumina)
★3 シークエンスデータ総論2(ロングリード:Oxford Nanopore)
★4 シークエンスデータ総論3(ロングリード:PacBio)
★8 Gene set enrichment 解析
★17 iModulon解析
★18 Riverplot
★19 Multi-group dotplot/Clustered dotplot

・変異とSNP(GWAS)

・発現
★26 バルクRNA-seq
★33 空間トランスクリプトーム解析1(シークエンスベース:Visiumなど)
★34 空間トランスクリプトーム解析2(イメージングベース:Xeniumなど)
★35 空間エピゲノム解析

・エピゲノム解析
★38 CUT&RUN/CUT&Tag

第9章 マイクロバイオーム・メタゲノム解析
★3 細菌ゲノムアセンブリ

第10章 臨床情報解析
★5 ネットワークメタアナリシス
★6 スイマープロット
★7 ウォーターフォールプロット
★8 スパイダープロット
★9 家系図
★10 バリアント表記法

第11章 機械学習
★1 機械学習(機械学習の分類・学習曲線)
★2 機械学習(目的関数・評価指標)
★3 アンサンブル学習
★4 説明な可能AI
★5 畳み込みニューラルネットワーク
★6 転移学習
★7 トランスフォーマー/アテンション機構
★8 セグメンテーション
★9 基盤モデル
★10 DNA,RNA,タンパク質の言語モデル
★11 AlphaFold
★12 GNN
★13 生成モデル
★14 AI創薬
★15 AIエージェントによる生命科学研究