［１］前奏曲とフーガ集（初期？i集）［２］トッカータとフーガ集［３］(1)コラール変奏曲集(2)パストラーレ ヘ短調ＢＷＶ５９０(3)カンツォーナ ニ短調ＢＷＶ５８８(4)アラ＝ブレーヴェ ニ長調ＢＷＶ５８６［４］オルガン小曲集(1)待降節用コラール(2)クリスマス用コラール(3)年末と新年のコラール(4)シメオンの歌(5)受難節のコラール［５］オルガン小曲集(1)復活節のコラール(2)聖霊降臨祭用コラール(3)われらが神はかたき砦ＢＷＶ７２０(4)いまぞ喜べ，愛するキリスト者の仲間たちＢＷＶ７３４(5)バビロン川のほとりでＢＷＶ６５３ｂ(6)天にいますわれらの父よＢＷＶ７３７(7)われ汝に別れを告げんＢＷＶ７３６(8)わが心の切なる願いＢＷＶ７２７［６］(1)パッサカリアとフーガ ハ短調ＢＷＶ５８２(2)幻想曲とフーガ集(3)コラールによるラゲッタ集（キルンベルガー・コラール）［７］ライプツィヒ・コラール集［８］(1)ライプツィヒ・コラール集（続き）(2)アルンシュタットからワイマールへ コラール集［９］トリオ・ソナタ集［１０］〈ドイツ・オルガン・ミサ〉(1)コラール集～キリエ（小ヴァージョン）(2)キリエ（大ヴァージョン）(3)グローリア(4)十戒(5)クレド(6)主の祈り(7)洗礼［１１］〈ドイツ・オルガン・ミサ〉(1)懺悔(2)聖餐(3)シュプラーコラール集［１２］前奏曲とフーガ集（後期？i集）